尽管集菌仪的作业因为其专业性和杂乱性而外包，但生物医学工程师依然有责任确保合格的承包商及时完结作业，近年来，该设备的办理呈现出一种新的杂乱程度，部分原因是设备的杂乱性和专业化程度的进步，与电子网络的集成，对专业保护和修理的外包依靠以及对合规性的要求不断进步。安全性，靠谱性和准 确性，所有这些问题都需求处理，同时坚持能够在任何时间为应用供给合适设备的设备库存，
经过运用集菌仪数据，医疗组织专业人员能够分析他们在无菌检测中运用的技能，并在降低成本的同时提高效率和合规性，在开端之前，卫生组织专业人员有必要树立基线，因为设施大小不同运用不同级别的技能，花费的金额并不是比较正确的，相反专业人士应该计算他们生物医学设备方案的服务本钱比率。
一些较新的设备办理模型包含输入更多类别以产生有价值的数据，能够提高集菌仪的靠谱性并降低保护成本，这些包含纠正，防备，关键要素，失败，条件分析，靠谱性要素和猜测服务类型的作业，经过将履行的保护或修复输入这些子类别，能够获得有关失败前的均匀运行时刻，常见服务的设备类型以及均匀持续时刻的有价值数据，增加到风险值和结果中，结果将经过提供很好的观察时间来提高效率。
如果设施专业人员没有时间立即完结整个库存进程，能够在一年的时刻内按类别分解进程，该库存需求尽可能完整，除了制造商和资产编号等显而易见的信息外，需求的范畴包含功用，使命关键性，利用率，备用集菌仪的可用性，故障频率，可检测性，故障后果，运行后果，停机时间，修理关键性，召回，制造商指南，保护类型，方案运行时间，保护是否外包，用户过错数量，将数据库导出到电子表格的功用，经过让增加字段和简略的排序，分析来改善该进程，不管医疗保健组织的专业人员是进行过完好的集菌仪审阅，还是按类别进行规划，这些信息都能够经过多种方式为企业供给服务。
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